Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MDP1-202ENST00000396833 582 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 ATP6AP2-211ENST00000636196 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
LRP2BPQ9P2M1 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms