Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Length 571 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 FBXO3-203ENST00000526785 5798 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
KLHL28Q9NXS3 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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