Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
MMP26Q9NRE1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
MMP26Q9NRE1 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms