Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NLRP1Q9C000 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 IGHV3-48-201ENST00000390624 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 CD300A-204ENST00000392625 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 DUTP3-201ENST00000450025 415 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 ORAOV1P1-201ENST00000503108 395 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AC004973.1-201ENST00000413240 635 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AC084781.1-201ENST00000613737 656 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 CYP4F23P-201ENST00000593402 1579 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 CTNNBIP1-201ENST00000377256 451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NLRP1Q9C000 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms