Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYE7

PCGF6, Polycomb group RING finger protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCGF6Q9BYE7 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 MLXIPL-204ENST00000414749 3224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 ALDH3B1-201ENST00000342456 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 CDH16-209ENST00000570262 2604 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 IFNAR2-202ENST00000342136 2899 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 HDAC9-208ENST00000417496 2524 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 LMAN2L-201ENST00000264963 2397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 SNX20-202ENST00000330943 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PCGF6Q9BYE7 AL121992.1-201ENST00000428945 2845 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.1 ms