Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 MBD1-201ENST00000269468 3259 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 FXYD6-207ENST00000527717 1799 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
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USP43Q70EL4 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
USP43Q70EL4 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 NDRG4-255ENST00000570248 3207 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
USP43Q70EL4 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
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