Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGL8

PXDC1, PX domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 231 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXDC1Q5TGL8 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CDIP1-201ENST00000399599 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC145098.2-201ENST00000623593 3026 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 LRCH3-203ENST00000425562 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TCAF2-205ENST00000444908 2976 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CAMKV-215ENST00000488336 2905 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 THBD-201ENST00000377103 4109 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 CCDC144NL-201ENST00000327925 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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PXDC1Q5TGL8 TBC1D13-202ENST00000372648 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IGFN1-201ENST00000295591 4439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 TMEM63B-202ENST00000323267 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 C7orf57-204ENST00000435376 1925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
PXDC1Q5TGL8 C7orf57-206ENST00000539619 1927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
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