Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW96

LDLRAP1, Low density lipoprotein receptor adapter protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRAP1Q5SW96 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 XRRA1-202ENST00000340360 5681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
LDLRAP1Q5SW96 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
LDLRAP1Q5SW96 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.3 ms