Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJF6

ODF2, Outer dense fiber protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 829 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF2Q5BJF6 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC35E2B-205ENST00000617444 6283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TMCC3-201ENST00000261226 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
ODF2Q5BJF6 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms