Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
ALFQ53S48 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms