Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 PLOD2-209ENST00000494950 2908 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PSEN1-202ENST00000357710 2776 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SERPINB1-201ENST00000380739 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CCDC60-201ENST00000327554 2450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ELMOD3-206ENST00000409890 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 BLZF1-201ENST00000329281 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PLAU-201ENST00000372764 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 Z98257.2-202ENST00000641138 1548 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VASH2-202ENST00000366964 2960 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC22A6-202ENST00000377871 2151 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DDX5-210ENST00000578804 2021 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 HARS-207ENST00000504156 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GRM2-202ENST00000395052 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 LINC00656-201ENST00000443744 1896 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EVL-214ENST00000555048 1715 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DUSP14-205ENST00000614411 2207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC015712.2-202ENST00000560068 3213 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AL354861.3-201ENST00000600140 2412 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 UGT3A1-203ENST00000503189 1902 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
KRTAP21-1Q3LI58 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms