Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
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E2F4Q16254 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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E2F4Q16254 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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E2F4Q16254 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
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E2F4Q16254 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
E2F4Q16254 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
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