Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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EFNB3Q15768 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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