Protein–RNA interactions for Protein: Q15758

SLC1A5, Neutral amino acid transporter B(0), humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A5Q15758 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SLC1A5Q15758 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.5 ms