Protein–RNA interactions for Protein: Q15648

MED1, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED1Q15648 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 DEPDC1-AS1-201ENST00000428732 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 RN7SL494P-201ENST00000461517 304 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
MED1Q15648 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AKR1B1-201ENST00000285930 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AC129102.1-201ENST00000535755 525 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
MED1Q15648 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AF274858.1-201ENST00000406288 372 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SLC9A3R2-204ENST00000563587 1037 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AL672207.1-201ENST00000328462 1570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AC138409.2-203ENST00000508395 553 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 BLOC1S5-205ENST00000543936 368 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 MED11-202ENST00000573708 802 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
MED1Q15648 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
MED1Q15648 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MED1Q15648 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC20.52■□□□□ 0.87
MED1Q15648 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms