Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TNN-202ENST00000621086 4234 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 RASGEF1A-202ENST00000374459 3264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ZNF501-205ENST00000620116 3382 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 SLC22A2-202ENST00000366953 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AL035078.1-201ENST00000531962 820 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 FIBCD1-202ENST00000372338 3253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 PPP5D1-201ENST00000414155 1882 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CCHCR1-203ENST00000396268 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 PCMTD2-204ENST00000369758 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 IFNA4-201ENST00000421715 978 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AFAP1-204ENST00000420658 7768 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 PAPSS2-202ENST00000456849 3856 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 USP2-201ENST00000260187 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AC090142.2-201ENST00000483263 416 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 AC084866.2-201ENST00000509956 449 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NBR1Q14596 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
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