Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
TUBA3CQ13748 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TUBA3CQ13748 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TUBA3CQ13748 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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TUBA3CQ13748 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GRAMD4-202ENST00000406902 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
TUBA3CQ13748 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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