Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
HDAC1Q13547 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 METTL17-202ENST00000382985 1586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
HDAC1Q13547 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
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