Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZDHHC4-201ENST00000335965 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TUBB4A-212ENST00000601152 590 ntTSL 4 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC14.1□□□□□ -0.15
SRSF6Q13247 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms