Protein–RNA interactions for Protein: Q13243

SRSF5, Serine/arginine-rich splicing factor 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 272 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF5Q13243 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TMEM177-203ENST00000409951 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 CMTM3-215ENST00000568477 687 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 AL805961.1-203ENST00000641078 1258 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SRSF5Q13243 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CENPX-208ENST00000584347 799 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SRSF5Q13243 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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