Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
LOXL1Q08397 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms