Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PTPN11Q06124 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PTPN11Q06124 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms