Protein–RNA interactions for Protein: Q05D60

DEUP1, Deuterosome assembly protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEUP1Q05D60 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
DEUP1Q05D60 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
DEUP1Q05D60 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms