Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GBE1Q04446 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GBE1Q04446 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms