Protein–RNA interactions for Protein: Q03188

CENPC, Centromere protein C, humanhuman

Predictions only

Length 943 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPCQ03188 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CENPCQ03188 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CENPCQ03188 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms