Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 MIR5572-201ENST00000583188 137 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 AL096828.3-201ENST00000615354 462 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SIM1P81133 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms