Protein–RNA interactions for Protein: P69849

NOMO3, Nodal modulator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOMO3P69849 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AC004223.3-201ENST00000593039 1638 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NOMO3P69849 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms