Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 DUSP27-201ENST00000271385 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PGGT1BP53609 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PGGT1BP53609 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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