Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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HOXD13P35453 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
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HOXD13P35453 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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HOXD13P35453 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
HOXD13P35453 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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