Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
VAV1P15498 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
VAV1P15498 CYP4X1-201ENST00000371901 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
VAV1P15498 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms