Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 USP40-201ENST00000251722 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC007614.4-201ENST00000564048 1827 ntBASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC9.98□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SLC9A3P3-201ENST00000457608 2229 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 MAML3-203ENST00000509479 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RBM39-205ENST00000397370 612 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.97□□□□□ -0.81
VPREB1P12018 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.97□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms