Protein–RNA interactions for Protein: P10826

RARB, Retinoic acid receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARBP10826 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RARBP10826 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 ZNF750-202ENST00000572562 1513 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RARBP10826 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RARBP10826 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms