Protein–RNA interactions for Protein: O75600

GCAT, 2-amino-3-ketobutyrate coenzyme A ligase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCATO75600 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GCATO75600 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
GCATO75600 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCATO75600 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCATO75600 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCATO75600 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCATO75600 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCATO75600 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCATO75600 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCATO75600 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GCATO75600 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GCATO75600 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GCATO75600 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms