Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CLGNO14967 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 USP19-208ENST00000453664 4719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SLC26A6-207ENST00000420764 2630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PROKR1-201ENST00000303786 4273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZIK1-204ENST00000597850 4181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AL356275.1-201ENST00000638446 7440 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SETD1A-201ENST00000262519 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FAM214B-204ENST00000378566 2566 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PARP3-202ENST00000417220 2472 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CLGNO14967 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms