Protein–RNA interactions for Protein: A6NEF3

GOLGA6L4, Golgin subfamily A member 6-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA6L4A6NEF3 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
GOLGA6L4A6NEF3 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 NRXN1-222ENST00000625672 8113 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RIC8B-202ENST00000392837 5135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GPSM2-202ENST00000406462 7433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 G3BP2-202ENST00000359707 4883 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GABRB3-219ENST00000636466 4509 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ST6GAL1-201ENST00000169298 4645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 SPG11-210ENST00000558319 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GOLGA6L4A6NEF3 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms