Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CCDC78A2IDD5 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 SAFB-205ENST00000588852 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
CCDC78A2IDD5 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms