Protein–RNA interactions for Protein: A2A3N6

PIPSL, Putative PIP5K1A and PSMD4-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIPSLA2A3N6 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
PIPSLA2A3N6 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PIPSLA2A3N6 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms