Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SMTN-201ENST00000333137 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
SH3BP1Q9Y3L3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LIMD2-201ENST00000259006 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
SH3BP1Q9Y3L3 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms