Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
UTP11Q9Y3A2 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
UTP11Q9Y3A2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms