Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
USP20Q9Y2K6 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
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USP20Q9Y2K6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
USP20Q9Y2K6 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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