Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 SNX1-214ENST00000625244 324 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CLMPQ9H6B4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CLMPQ9H6B4 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms