Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW19

KIFC1, Kinesin-like protein KIFC1, humanhuman

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIFC1Q9BW19 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
KIFC1Q9BW19 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.4 ms