Protein–RNA interactions for Protein: Q99081

TCF12, Transcription factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 682 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF12Q99081 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
TCF12Q99081 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.1 ms