Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MBD1-217ENST00000588937 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
C9orf72Q96LT7 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
C9orf72Q96LT7 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms