Protein–RNA interactions for Protein: Q8N283

ANKRD35, Ankyrin repeat domain-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD35Q8N283 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 KLK3-211ENST00000597483 810 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ANKRD35Q8N283 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD35Q8N283 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD35Q8N283 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD35Q8N283 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD35Q8N283 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD35Q8N283 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ANKRD35Q8N283 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms