Protein–RNA interactions for Protein: Q7L099

RUFY3, Protein RUFY3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY3Q7L099 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RUFY3Q7L099 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.1 ms