Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PLEKHB2-211ENST00000628582 1297 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AL645939.5-201ENST00000606834 243 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 DPM3-202ENST00000368399 517 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
FSCN1Q16658 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms