Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 STX1A-203ENST00000395155 783 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
EFNB3Q15768 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
EFNB3Q15768 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms