Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SUSD5-201ENST00000309558 5008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TPRX1-202ENST00000535759 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
TOP3AQ13472 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
TOP3AQ13472 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.6 ms