Protein–RNA interactions for Protein: Q13029

PRDM2, PR domain zinc finger protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,718 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2Q13029 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 LINC00969-294ENST00000627609 992 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC092265.1-201ENST00000422638 498 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 FERD3L-201ENST00000275461 640 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 GNAO1-205ENST00000563661 1351 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC009163.3-201ENST00000563554 852 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC020934.2-201ENST00000592400 456 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 CTSL-201ENST00000340342 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 STK16-203ENST00000409516 895 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PRDM2Q13029 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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